Schriftliche Ausarbeitung und darauf basierende Präsentation

Dieses Modul beschäftigt sich mit der praktischen Anwendung grundlegender Techniken und Werkzeuge des computergestützten Wirkstoffentwurfs. Dazu werden die Programmpakete BALLView, VMD, Glide, Prime und Modeller eingesetzt. Zunächst steht dabei die Aufbereitung und Visualisierung von 3D-Strukturen im Vordergrund. Außerdem werden spezifische intramolekulare Wechselwirkungen von Protein-Ligand-Komplexen genauer betrachtet und ausgewählte Liganden in ein pharmazeutisch interessantes Target gedockt. Im zweiten Teil des Praktikums stehen virtual high-throughput screening und rationaler strukturbasierter Wirkstoffentwurf im Mittelpunkt.

(1) Die Studierenden können grundlegend mit Standardwerkzeugen des strukturbasierten Wirkstoffentwurfs umgehen, (2) sind mit dem praktischen Umgang mit Protein- und Ligandenstrukturen vertraut und (3) sie können die Ergebnisse dieser Werkzeuge und Techniken interpretieren und kritisch bezüglich ihrer Relevanz beurteilen.

Materialien werden zur Verfügung gestellt.