Nummer

BIOINF4110 (entspricht BIO-4110) 		Titel

Sequence Bioinformatics 		Lehrform(en)

Vorlesung, Übung
ECTS 9
Arbeitsaufwand
- Kontaktzeit
- Selbststudium
Arbeitsaufwand:
270 h
Kontaktzeit:
90 h / 6 SWS
Selbststudium:
180 h
Veranstaltungsdauer 1 Semester
Häufigkeit des Angebots Im Wintersemester
Unterrichtssprache Englisch
Prüfungsform

Klausur oder mündliche Prüfung
Inhalt

Dieser Kurs behandelt sequenzbasierte Bioinformatik und Evolution. Die Hauptthemen sind paarweises Alignment, BLAST und verwandte Heuristiken, Suffixbäume und ihre Anwendungen, Sequenzassemblierung, multiples Alignment, Hidden-Markov-Modelle, Gensuche, Motivsuche, Methoden des maschinellen Lernens, Modelle der DNA-Evolution, Phylogenie, Phylogenie des gesamten Genoms, Berechnungsmethoden in der Genomik und Metagenomik.
Qualifikationsziele

Das erste Ziel dieses Kurses ist es, die Studierenden in fortgeschrittene Konzepte und Methoden der Bioinformatik einzuführen, wobei der Schwerpunkt auf algorithmischen, rechnerischen und mathematischen Aspekten liegt. Das zweite Ziel dieses Kurses ist es, die Studierenden in die Lage zu versetzen, fortgeschrittene Methoden auf Probleme in der Molekularbiologie und verwandten Gebieten anzuwenden. Nach dem Besuch dieses Kurses werden die Studierenden ein gutes Verständnis der wichtigsten Ansätze in der sequenzbasierten Bioinformatik haben und wissen, welche Probleme mit diesen Methoden angegangen werden können und wie sie diese Methoden anwenden können.
Vergabe von Leistungspunkten/Benotung
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%)
Vorlesung
V
o
4
6.0
K
90
b
100
Übung
Ü
o
2
3.0
Teilnahmevoraussetzungen Es gibt keine besonderen Voraussetzungen.
Dozent/in Huson
Literatur / Sonstiges

Lecture notes and scientific publications
Zuletzt angeboten nicht bekannt
Geplant für derzeit nicht geplant
Zugeordnete Studienbereiche BIO-SEQ, INFO-INFO, MEDI-APPL, MEDI-INFO, MEDZ-BIOINFO, MEDZ-RES, ML-CS