Arbeitsaufwand:
90 h
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Nummer BIOINF4270 |
Titel Computational Workflows for Biomedical Data |
Lehrform(en) Praktikum |
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| ECTS | 3 | |
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Arbeitsaufwand - Kontaktzeit - Selbststudium |
Arbeitsaufwand:
90 h Kontaktzeit:
30 h / 2 SWS Selbststudium:
60 h |
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| Veranstaltungsdauer | 1 Semester | |
| Häufigkeit des Angebots | Unregelmäßig | |
| Unterrichtssprache | Englisch | |
| Prüfungsform | Vorstellung und Verteidigung der Forschungsergebnisse schriftlich und mündlich. |
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| Inhalt | In diesem Praktikum lernen Studierende komplexe biomedizinische Datenanalyse-Probleme in Workflows zu modellieren. Unter Zuhilfenahme abstrakter Workflow-Beschreibungen implementiere die Studierenden neue komputationale Workflows mittels der Workflow-Sprache "nextflow" implementiert. Zudem nutzen sie existierende Workflows und erarbeiten wissenschaftliche Lösungsansätze für konkrete Problemstellungen bei der Analyse biomedizinischer Daten. |
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| Qualifikationsziele | Die Studierenden können nach dem Praktikum Problemstellungen der biomedizinischen Forschung abstrahieren und als Workflow modelieren. Sie werden befähigt einfache Workflows mit "nextflow" zu implementieren und eine Vielfalt von existierenden “best-practice” Workflows zu nutzen. |
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| Vergabe von Leistungspunkten/Benotung |
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%)
Praktikum
P
o
2
3.0
H,
R
b
100
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| Teilnahmevoraussetzungen | Es gibt keine besonderen Voraussetzungen. | |
| Dozent/in | Nahnsen | |
| Literatur / Sonstiges | Ewels et al., Nature Biotechnology, 2020; Weitere Literatur wird im Praktikum bekannt gegeben / Further literature will be announced in the course. |
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| Zuletzt angeboten | nicht bekannt | |
| Geplant für | Sommersemester 2024 | |
| Zugeordnete Studienbereiche | BIO-PRAK | |