Nummer

BIOINF4311 (entspricht BIO-4311) 		Titel

Mikrobiomanalyse 		Lehrform(en)

Vorlesung, Übung
ECTS 6
Arbeitsaufwand
- Kontaktzeit
- Selbststudium
Arbeitsaufwand:
180 h
Kontaktzeit:
60 h / 4 SWS
Selbststudium:
120 h
Veranstaltungsdauer 1 Semester
Häufigkeit des Angebots Unregelmäßig
Unterrichtssprache Englisch
Prüfungsform

Klausur oder mündliche Prüfung
Inhalt

Dieser Kurs bietet eine ausführliche Einführung in die Mikrobiomanalyse. Die Themen umfassen: Sequenziertechnologien, Erstellung von Gemeinschaftsprofilen mithilfe des SSU rRNA-Gens, Erstellung von Gemeinschaftsprofilen durch Shotgun-Sequenzierung, Alignment-freie und Alignment-basierte taxonomische Profilerstellung, Funktionelle Analyse und Profilerstellung, Probenvergleich und Zeitserienanalyse.
Qualifikationsziele

Die Studierenden kennen die neuesten bioinformatischen Erkenntnisse zur Mikrobiomanalyse. Sie können die Herausforderungen der Mikrobiomanalyse für die Bioinformatik formulieren. Sie kennen Algorithmen zur taxonomischen und funktionalen Analyse von Mikrobiom-Sequenzierungsdaten, statistische Methoden zum Vergleich und Methoden zur Erstellung von Community-Profilen anhand von 16S-Sequenzen. Die Studierenden können Mikrobiom-Sequenzierungsdaten analysieren und Profiling und Vergleiche durchführen. Sie kennen sowohl die Möglichkeiten als auch die Grenzen der verschiedenen Methoden in diesem Teilgebiet der Bioinformatik. Sie sind in der Lage, Problemstellungen auf wissenschaftlichem Niveau zu analysieren und schriftlich zusammenzufassen. Insbesondere wird ein hohes Maß an intrinsischer Motivation und Eigenverantwortung gefördert.
Vergabe von Leistungspunkten/Benotung
Lehrform
Status
SWS
LP
Prüfungsform
Prüfungsdauer
Benotung
Berechnung
Modulnote (%)
Vorlesung
V
o
2
4.0
K
90
b
100
Übung
Ü
o
2
2.0
Teilnahmevoraussetzungen Es gibt keine besonderen Voraussetzungen.
Dozent/in Huson
Literatur / Sonstiges

Lecture notes and scientific publications
Zuletzt angeboten Sommersemester 2021
Geplant für derzeit nicht geplant
Zugeordnete Studienbereiche BIO-BIO, INFO-INFO, INFO-PRAK, MEDI-APPL, MEDI-INFO, MEDZ-BIOMED, ML-CS